Das Team Science and Research Hessen
 

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Projektdatenblatt
Projektname: SIMAP@home
Status:
Forschungsart: Medizin - Proteinstrukturforschung
Beschreibung: SIMAP ist eine Datenbank, in der die Ähnlichkeiten aller derzeit bekannten Proteinsequenzen untereinander gespeichert sind. Man kann sich das als Matrix vorstellen, die quadratisch ist bei einer Kantenlänge von ca. 4 Mio Proteinsequenzen die wir momentan speichern. Der Inhalt der Matrix ist symmetrisch, das heißt wenn Protein 1 dem Protein 2 ähnlich ist, dann ist es umgekehrt genauso. SIMAP ist weltweit das einzige derartige Projekt, bei dem wirklich alle Proteine einbezogen werden. Das "Konkurrenzprojekt" clustr am European Bioinformatics Institute beschränkt sich derzeit auf ca. 1/5 unserer Datenmenge.
Teilnehmen:

- Sie müssen BOINC zuerst installiert ANLEITUNG
- Im Manager "Projekt hinzufügen" auswählen
- Die Anmeldeadresse lautet
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/

Nehmen Sie bereits an dem Projekt teil, so können Sie sich hier unserem Team anschließen !

Platzbedarf: bis 150 MB
Dauer: 30 bis 60 Minuten
Anwendung: simap5.07
Läuft mit: winWin  LinuxLinux   ( MacOS / Unix  vorgesehen )
Leitung: Genome Oriented Bioinformatics - TU Munich
Leiter: Thomas Rattei
SaR Teamleiter: Proxima

Was ist SIMAP@home ?
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